晶体结构课程培训 - 培训

                                   第一天

一、晶体结构导论

1.晶体及单晶结构分析发展与简史及分析过程

2.晶体学基础;点阵与对称元素、等效点系、布拉维（Bravais）格子、点群与空间群

3.晶体物理基础：群论基础、对称性与物理性质的关系、物性张量、不可约表示、

子群与相变  

4.结构解析理论基础：直接法、charge flipping法、最小二乘精修

二、晶体结构解析与精修

一、晶体结构解析

1.1结构解析的过程与相角问题 1.2傅里叶合成 1.3帕特森方法 1.4直接法

1.5结构解析中的若干问题

二、晶体结构精修

2.1结构精修与最小二乘法  2.2权重方案与残差因子 2.3精修技巧

2.4结构精修中的若干问题  2.5结构精修结果的检查

三、单晶结构分析及绘图

1.晶体学信息文件、数据库与程序资源

1.1 CIF的定义与产生方法 1.2 CIF格式与检查 1.3 CIF实例 1.4晶体学数据库

1.5一些单晶结构分析及绘图程序简介

四、 SHELXTL程序与结构解析和精修

1.SHELXTL主要子程序简介 2.XPREP模块 3.XS模块 4.XP：结构模型的检查和修改

5.XL模块6.XP：画图 7.XCIF模块

（掌握Shelxtl单晶结构解析的基本方法和通用流程）

讲解特殊结构的处理方法：Platon使用方法、双晶和无序结构的处理、格子人工转换

五、无序结构精修及实例应用

1.无序结构精修基本原理与方法  2.高氯酸根离子  3.环戊二烯基

4.混合配体的无序 5.苯环与烷基链的无序 6.DMF分子的两重无序

7.金属离子掺杂引起的无序

8.实例与训练，掌握双晶，非公度和四维调制结构的处理、无序与温度因子的高阶精修

                            第二天

六、Jana

1.讲解Jana各模块使用方法：EditM50, Edit atoms, Edit profile, Structure solution, Refine等

2.实例讲解与训练，掌握Jana单晶结构解析的基本方法和通用流程

3.讲解特殊结构理论：双晶，非公度和四维调制结构（modulated structures）解析、无序与温度因子高阶精修

4.实例讲解：掌握双晶，非公度和四维调制结构的处理、无序与温度因子的高阶精修

七、Olex和Fullprof

1.讲解Olex使用方法，Olex解结构基本流程

2.讲解Fullprof程序和各模块的使用：WinPlotr,   Edit PCR等

3.实例讲解与训练：掌握Fullprof的基本操作、粉末XRD峰的指标化、Retiveld精修

4.实例讲解与训练：粉末XRD法解结构

(针对问题：对于只知道大致结构模型和构筑单元，但没有单晶衍射数据的化合物，如何通过粉末XRD谱的模拟退火算法得到单晶结构)

八、结构解析实例

1.经典配合物与空间群P1 2.有机天然产物绝对结构(构型)的确定

3.外消旋化合物与手性空间群 4.含有多个分子的独立单元

6.晶体结构与氢键及其表达 7.具有孔洞结构的配位聚合物 8.非缺面孪晶

9.用铜靶光源确定不含重原子的有机物绝对构型及金属一有机物晶体的衍射数据

10.超低温晶体衍射数据的收集