TBtools 多功能生物信息可视化集成平台培训课程-曙海培训中心

TBtools 多功能生物信息可视化集成平台培训课程

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• 培训对象：植物科学研究人员、非模式生物研究者、湿实验科学家、需要便捷的生物信息分析工具且编程经验有限的科研人员。

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• 培训目标：

  1. 掌握TBtools的安装与界面操作，能够利用图形界面完成常见的生物信息分析任务。

  2. 熟练使用序列提取、格式转换、基因结构可视化等核心功能，加速日常数据处理。

  3. 掌握基因家族分析、共线性分析等高级应用，能够独立完成基因家族研究的全套流程。

• 培训内容介绍：

  1. TBtools平台概览：了解TBtools作为国产多功能生物信息工具的发展历程，熟悉菜单结构与功能分类。

  2. 安装与环境配置：安装Java运行环境，下载TBtools并完成基础配置，熟悉插件管理。

  3. 序列数据处理：使用序列提取工具从基因组中提取CDS、蛋白序列或指定区域序列。

  4. 格式转换工具：在GFF/GTF、BED、FASTA等多种格式间进行转换，适应不同软件输入要求。

  5. 基因结构可视化：根据GFF注释和序列信息，绘制包含外显子-内含子结构的基因结构图。

  6. 染色体分布绘制：将基因位置信息映射到染色体示意图上，展示基因的染色体分布。

  7. Blast比对与结果处理：在TBtools中运行本地Blast，对Blast结果进行筛选和可视化。

  8. 保守结构域分析：集成Pfam/InterProScan，对候选基因进行保守结构域鉴定与可视化。

  9. 基因家族成员鉴定：结合Blast和结构域筛选，完成目标物种中特定基因家族成员的鉴定流程。

  10. 多序列比对与motif分析：进行多序列比对，使用MEME Suite识别保守motif并可视化。

  11. 共线性分析：进行物种内或物种间的共线性分析，绘制共线性圈图或点图。

  12. 综合实战演练：以基因家族研究为例，完成从序列获取、成员鉴定到多图组合发表的全流程。